Batmanin (2004) 1. tuotantokausi alkoi Yhdysvalloissa11. syyskuuta2004 jaksolla The Bat in the Belfry, joka tunnetaan Suomessa nimellä Uhka taivaalta. 1. kausi käsittää kolmetoista jaksoa. Yhdysvalloissa ensimmäisen kauden esitys päättyi 7. toukokuuta2005.
Suomessa 1. tuotantokausi käynnistyi 2. syyskuuta2006 ja päättyi 14. lokakuuta2006. Kauden kuusi ensimmäistä jaksoa on julkaistiin Suomessa DVD:lle dubattuna samana vuonna ja kaikki jaksot sisältävä boksi vuotta myöhemmin[1]. DVD:llä jaksojen nimet olivat yhtä lukuun ottamatta erit kuin televisioesityksissä.
Pysäytettyään Thornen, Batman palaa takaisin lepakkoluolaansa ja saa huomata, että Arkhamin mielisairaalan vangit ovat salaperäisesti päässeet vapaaksi. Paikalle saapuessaan hän huomaa Jokerin ottaneen ohjat käsiinsä mielisairaalassa, jonka myötä hän karkaa kuumailmapallon kyydissä Gothamin taivaalle yrittääkseen levittää Jokeri kaasua Gothamin ylle.
Batman taistelee naamioitunutta rikollista vastaan nimeltä Bane, mutta kun Bane aktivoi hänen kemikaalisen steroidinsa, Batman huomaa olevansa tappiolla jättiläismäistä Banea vastaan.
Pingviinillä on harhaluulo siitä miten rakentaa uudestaan kadonneet Cobblepot-suvun omaisuudet. Tietämätön Alfred menee Cobblepotin kartanoon, jossa hänet kidnappaa Ozzy alias Pingviini. Joka uhkaa Alfredia joutumaan linnun ruuaksi ellei Batman ilmesty paikalle pelastamaan Alfredin.
Wayne-yhtiön laboratoriossa työskentelevä tiedemies Tohtori Langstrom on tehnyt kokeita lepakoilla. Brucen vieraillessa Tri. Langstromin laboratoriossa, Langstrom juo seerumin, jonka myötä hän muuttuu ihmislepakoksi ja lähtee riehumaan Gothamin ilmoille.
Kun uutiset väittävät Batmanin ja Kissanaisen olevan rikoskumppaneita, Kissanainen päättää tavata öisen parinsa ja houkuttelee hänet ansaan varastaakseen Batmanin vyön, jonka avulla Kissanainen saisi varastettua arvokkaan patsaan.
Tulikärpänen murtautuu useisiin yhtiöihin Gothamissa ja tuhoaa heidän teknologiaa. Batmanin huomatessa ettei Tulikärpästä ole helppo pysäyttää, hänelle tulee vastaan toinenkin ongelma, kun pormestari Grange kertoo Bruce Waynelle, että hänen elämän tyylinsä vuoksi Brucen yhtiön rahoitusta lastensairaalaalle ei otettaisikaan vastaan vaan se menisi GothCorpille, joka on valmis rahoittamaan lastensairaalaa.
Batman pääsee Vihjemestarin jäljille, kun tämä entinen visailumestari hakee kostoa visailuohjelman tuottajilta, joita hän syyttää itsensä huijaamisesta. Vihjemestari suunnittelee kidnappaavansa kaikki osanottajat uusintaotteluun, mutta tällä kertaa väärästä vastauksesta joutuu lähemmäs kohti kuolemaa.
Arnold Wesker kantaa mukanaan käsinukkea, jolla on aivan toisenlainen persoonallisuus kuin Weskerillä itsellään. Yhdessä he ryöstävät Gothamia ja Arpinaama lupaa Weskerille seuraavan keikan olevan viimeinen. Yrittäessään varastaa kultaharkkoja pankista, mutta Batman ilmestyy jälleen paikalle pysäyttämään heidät. Sillä välin Alfred yrittää löytää sopivaa deittiä Brucelle.
Batman alkaa tutkimaan arkkivihollisensa Jokerin viimeaikaisia rikoksia, jotka tuntuvat mahdottomilta sillä Batman laittoi jo Jokerin takaisin vankilaan. Päästessään Jokerin uhrien jäljille, hän huomaa Jokerin laittaneen heidät jättiläismäisiin pelikortteihin.
Sillä välin, kun Bruce Waynesta tehdään tv-jaksoa hänen arkipäivän rutiineista, Pingviini punoo uusinta juontaan. Hän nappaa Alfredin panttivangiksi Bruce Waynen omassa kartanossaan ja Brucen täytyy löytää keino päästäkseen eroon kamera ryhmästä, jotta voisi pysäyttää Pingviinin Batmaninä.
Jokeri on kehittänyt uuden aineen, jolla hän pystyy muuttamaan esineitä saveksi. Sillä välin poliisipäällikkö Angel Rojas painostaa etsiviään nappaamaan Batmanin ja kaikki muut naamiorikolliset.
Batman kohtaa uuden pahiksen nimeltä Savinaama, joka pystyy muuttamaan kehoaan keneksi ja miksikä tahansa. Ennen kuin Batman saa pysäytettyä hänet, hän saa tietää Savinaaman järkyttävän salaisuuden.