LIN28B

LIN28B
Saatavilla olevat rakenteet
PDB	Ortologiahaku: PDBe RCSB
Luettelo PDB-tunnisteita
	4A4I
Tunnisteet
Aliakset	LIN28B, CSDD2, lin-28 homolog B
Muut tunnisteet	OMIM: 611044; MGI: 3584032; HomoloGene: 47607; GeneCards: LIN28B; OMA:LIN28B - orthologs
Geenisijainti (Ihminen)
Kromosomi	Kromosomi 6 (ihminen)
Loppu	105,083,332 bp
Geenisijainti (Hiiri)
Kromosomi	Kromosomi 10 (hiiri)
Loppu	45,362,491 bp
RNA-ilmenemisen kaava
	Top expressed in
	istukka; ; buccal mucosa cell; ; Sukupuolirauhaset; ; kives; ; secondary oocyte; ; sperm; ; decidua; ; Brodmann area 23; ; right testis; ; left testis;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; Tsygootti; ; secondary oocyte; ; alkio; ; alkio; ; primary oocyte; ; genital tubercle; ; spermatocyte; ; epiblast; ; morula;
	More reference expression data
	n/a
Geenin ontologia
Molekulaarinen toiminto	DNA binding; zinc ion binding; Proteiinisitoutuminen plasmassa; metal ion binding; RNA binding; nucleic acid binding;
Solukomponentti	solulima; tuma; Tumajyvänen; sytosoli;
Biologinen prosessi	pre-miRNA processing; miRNA catabolic process; gene silencing; regulation of transcription, DNA-templated; RNA 3'-end processing;
	Lähteet:Amigo / QuickGO
Ortologia
	389421
	380669
	ENSG00000187772
	ENSMUSG00000063804
	Q6ZN17
	Q45KJ6
	NM_001004317
	NM_001031772; NM_001033152
	NP_001004317
	NP_001026942
	Wikidata
Ihminen Wikidatassa	Hiiri Wikidatassa

LIN28B on ihmisissä ja muissa selkärankaisissa oleva geeni, joka koodaa Lin28b-proteiinia. Lin28b on tiettyä mikroRNA:ta sitova proteiini, joka vaikuttaa eläimen murrosiän alkamisajankohtaan.^[5]

Ihmisillä LIN28B-geeni on kromosomissa 6 kohdassa 6q16.3-q21.^[6] Tämä geeni koodaa Lin28b-proteiinia. Ihmisillä on myös LIN28A-geeni, joka koodaa Lin28a-proteiinia. Lin28b ja Lin28a ovat sekvensseiltään ja toiminnoiltaan samankaltaisia. Soluissa Lin28b tosin on sijoittunut tumajyväsiin. Lin28a taas on sijoittunut solulimaan ja tumaan. Lin28b ja Lin28a löytyvät ihmisten lisäksi kaikilta selkärankaisilta. Muun muassa selkärangattomiin lukeutuvilla eleganssimadoilla ja banaanikärpäsillä näiden proteiinien toimintoa vastaa vain yksi geeni, joka koodaa Lin28-proteiinia.^[7]

Muun muassa ihmisissä Lin28a- ja Lin28b-proteiineja muodostuu laajalti eri kudoksissa sikiövaiheessa. Syntymän jälkeen niiden tuotto rajoittuu lähinnä vain hypotalamukseen, aivolisäkkeeseen ja kiveksiin tai munasarjoihin.^[5]

Lin28a ja Lin28b sitoutuvat tiettyyn mikroRNA:han estäen siten sen kykyä säädellä geeniekspressiota. Näiden proteiinien tuotto estää gonadoliberiinin, FSH:n ja luteinisoivan hormonin tuottoa. Murrosiässä Lin28a- ja Lin28b-proteiinien tuotto vähenee. Tämä laukaisee osaltaan murrosiässä havaittavia muutoksia, jotka johtuvat osin edellä mainittujen hormonien tuoton kasvusta. Lin28a- ja Lin28b tuoton väheneminen aikaistavat ihmisillä siten esimerkiksi kuukautisten ja äänenmurroksen ilmenemisen ajankohtaa. Näiden proteiinien toiminto liittyy muillakin eläimillä sukukypsyyteen.^[5]

Lin28a- ja Lin28b proteiineista on ihmisillä useita SNP-mutaatioita. Nämä vaikuttavat muun muassa ihmisen lopulliseen pituuteen ja murrosiän alkamisajankohtaan.^[5]

Lähteet

↑ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000187772 – Ensembl, May 2017
↑ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000063804 – Ensembl, May 2017
↑ Human PubMed Reference: ncbi.nlm.nih.gov.
↑ Mouse PubMed Reference: ncbi.nlm.nih.gov.
↑ ^a ^b ^c ^d G Cao et al: Lin28 gene and mammalian puberty. Molecular Reproduction and Development, 2020. doi:10.1002/mrd.23347 ISSN 1098-2795 Artikkelin verkkoversio.
↑ protein lin-28 homolog B [Homo sapiens] - Protein - NCBI ncbi.nlm.nih.gov. Viitattu 8.5.2020.
↑ J Tsialikas, J Romer-Seibert: LIN28: roles and regulation in development and beyond. Development, 2015, 142. vsk, nro 14, s. 2397–2404. PubMed:26199409 doi:10.1242/dev.117580 ISSN 0950-1991 Artikkelin verkkoversio.

Tämä biologiaan liittyvä artikkeli on tynkä. Voit auttaa Wikipediaa laajentamalla artikkelia.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000187772 – Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000063804 – Ensembl, May 2017

[3] Human PubMed Reference: ncbi.nlm.nih.gov.

[4] Mouse PubMed Reference: ncbi.nlm.nih.gov.

[a-5] G Cao et al: Lin28 gene and mammalian puberty. Molecular Reproduction and Development, 2020. doi:10.1002/mrd.23347 ISSN 1098-2795 Artikkelin verkkoversio.

[6] rotein lin-28 homolog B [Homo sapiens] - Protein - NCBI ncbi.nlm.nih.gov. Viitattu 8.5.2020.

[7] J Tsialikas, J Romer-Seibert: LIN28: roles and regulation in development and beyond. Development, 2015, 142. vsk, nro 14, s. 2397–2404. PubMed:26199409 doi:10.1242/dev.117580 ISSN 0950-1991 Artikkelin verkkoversio.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

LIN28B

Lähteet

Navigointivalikko

Haku