JMJD2C

KDM4C
Saatavilla olevat rakenteet
PDB	Ortologiahaku: PDBe RCSB
Luettelo PDB-tunnisteita
	2XDP, 2XML, 4XDO, 4XDP, 5FJK, 5FJH
Tunnisteet
Aliakset	KDM4C, GASC1, JHDM3C, JMJD2C, TDRD14C, bA146B14.1, lysine demethylase 4C
Muut tunnisteet	OMIM: 605469; MGI: 1924054; HomoloGene: 41004; GeneCards: KDM4C; OMA:KDM4C - orthologs
Geenisijainti (Ihminen)
Kromosomi	Kromosomi 9 (ihminen)
Loppu	7,175,648 bp
Geenisijainti (Hiiri)
Kromosomi	Kromosomi 4 (hiiri)
Loppu	74,324,097 bp
RNA-ilmenemisen kaava
	Top expressed in
	right hemisphere of cerebellum; ; epithelium of colon; ; bone marrow cells; ; Nielurisa; ; akillesjänne; ; sural nerve; ; Aivokurkiainen; ; body of pancreas; ; monosyytti; ; jyvässolu;
	Top expressed in
	saccule; ; neural layer of retina; ; otic vesicle; ; otic placode; ; Kyynelrauhanen; ; verkkokalvon pigmenttiepiteeli; ; jyvässolu; ; interventricular septum; ; käpyrauhanen; ; superior cervical ganglion;
	More reference expression data
	; ;
	Lisää ilmenemistietoa
Geenin ontologia
Molekulaarinen toiminto	oxidoreductase activity; histone H3-methyl-lysine-9 demethylase activity; dioxygenase activity; metal ion binding; chromatin binding; enzyme binding; histone demethylase activity; androgen receptor binding; zinc ion binding; histone H3-methyl-lysine-36 demethylase activity; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; methylated histone binding;
Solukomponentti	tuma; tumalima; pericentric heterochromatin; histone methyltransferase complex;
Biologinen prosessi	regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; positive regulation of cell population proliferation; blastocyst formation; geeniekspression säätely; positive regulation of gene expression; histone H3-K9 demethylation; positive regulation of neuron differentiation; negative regulation of histone H3-K9 trimethylation; regulation of stem cell population maintenance; regulation of stem cell differentiation; histone H3-K36 demethylation; chromatin organization; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; chromatin remodeling; stem cell population maintenance;
	Lähteet:Amigo / QuickGO
Ortologia
	23081
	76804
	ENSG00000107077
	ENSMUSG00000028397
	Q9H3R0
	Q8VCD7
NM_001146694; NM_001146695; NM_001146696; NM_001304339; NM_001304340;
	NM_001304341; NM_015061; NM_001353997; NM_001353998; NM_001353999; NM_001354000; NM_001354001
	NM_001172095; NM_144787; NM_001356561
NP_001140167; NP_001140168; NP_001291268; NP_001291269; NP_001291270;
	NP_055876; NP_001340926; NP_001340927; NP_001340928; NP_001340929; NP_001340930
	NP_001165566; NP_659036; NP_001343490
	Wikidata
Ihminen Wikidatassa	Hiiri Wikidatassa

JMJD2C on eräs ihmisen geeneistä. Geeni sijaitsee kromosomissa 9p24.1 ^[5] Geeni assosioituu autismiin. Geeni jakautuu 21 eksoniin. Geenio koodaa GASC1 proteiineja, jotka puolestaan säätelevät geenien transkriptiota ottamalla pois histoniproteiinien metyyliryhmiä, jotka pakkaavat kromatiineja.

Lähteet

↑ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000107077 – Ensembl, May 2017
↑ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028397 – Ensembl, May 2017
↑ Human PubMed Reference: ncbi.nlm.nih.gov.
↑ Mouse PubMed Reference: ncbi.nlm.nih.gov.
↑ SLC1A1- ja JMJD2C-geenien assosiaatio autismin kirjoon suomalaisessa väestössä, Theseus.fi, 27.2.2009

Tämä biologiaan liittyvä artikkeli on tynkä. Voit auttaa Wikipediaa laajentamalla artikkelia.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000107077 – Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028397 – Ensembl, May 2017

[3] Human PubMed Reference: ncbi.nlm.nih.gov.

[4] Mouse PubMed Reference: ncbi.nlm.nih.gov.

[5] SLC1A1- ja JMJD2C-geenien assosiaatio autismin kirjoon suomalaisessa väestössä, Theseus.fi, 27.2.2009

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

JMJD2C

Lähteet

Navigointivalikko

Haku