FRET
Tämän artikkelin tai sen osan viitteitä on pyydetty muotoiltavaksi. Voit auttaa Wikipediaa muotoilemalla viitteet ohjeen mukaisiksi, esimerkiksi siirtämällä linkit viitemallineille. Tarkennus: otsikot suomeksi suomenkielisesä wikipediassa |
FRET eli Försterin resonanssienergiansiirto eli fluoresenssi-resonanssi-energiansiirto (engl. Förster resonance energy transfer tai fluorescent resonance energy transfer) on valokemiallinen ilmiö, jossa virittynyt molekyyli siirtää energiansa toiselle, riittävän lähellä olevalle molekyylille.lähde?
Nimi
[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]FRET on saanut nimensä saksalaisen fyysikon Theodor Försterin mukaan. Muotoa fluoresenssi-resonanssi-energiansiirto käytetään runsaasti tieteellisessä kirjallisuudessa, mutta tarkkaan ottaen se kuvaa vain FRET:in erikoistapausta, jossa sekä energiaa luovuttava (donori) että vastaanottava (akseptori) molekyyli ovat fluoresoivia. FRET esiintyy myös muissa yhteyksissä, esim. fosforesenssissa.lähde?
Energiansiirto
[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]Virittynyt molekyyli voi siirtää energiansa toiselle molekyylille, jos ne ovat riittävän lähellä toisiaan (~30-60 Å[1]). Kyseessä on säteilemätön (ei-radiatiivinen) siirtymä, jossa ei emittoidu fotonia, vaan energia siirtyy dipoli-dipoli-vuorovaikutuksen kautta[1]. Se voi tapahtua, jos donorin emissiospektri osuu osittain päällekkäin akseptorin absorptiospektrin kanssa. Tällöin kummankin molekyylin vibraatiotilojen väliset energiat ovat käytännössä samat, eli ne ovat resonanssissa.lähde?
Energiansiirron nopeutta kuvaa seuraava yhtälö[1]:
missä τD on donorin fluoresenssin elinaika, R0 on Försterin säde eli etäisyys, missä energiansiirron tehokkuus on 50%, ja r on etäisyys donorin ja akseptorin välillä.
Tästä voidaan johtaa yhtälö energiansiirron tehokkuudelle[1], eli sen kvanttisuhteelle E:
Nähdään, että siirron tehokkuus on kääntäen riippuvainen molekyylien välisen etäisyyden kuudenteen potenssiin, eli se heikkenee erittäin nopeasti etäisyyden kasvaessa.lähde?
Merkitys
[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]FRET:illä on monia käyttökohteita solubiologiassa, biokemiassa ja biofysiikassa.
Sitä käytetään usein proteiinien vuorovaikutusten seuraamiseen. FRET soveltuu myös proteiinin rakenneosien välisten etäisyyksien määrittämiseen: proteiinin eri osat leimataan fluoresoivilla molekyyleillä, ja niiden emissioista voidaan määrittää etäisyys. Tätä voidaan käyttää proteiinin konformaation määrittämiseen ja funktionaalisten muutoksien seuraamiseen proteiinin rakenteessa.[2]
FRET soveltuu myös DNA:n ja RNA:n analysoinnissa[3][4]; solukalvojen ja muiden membraanien tutkimiseen[5]; sitä voidaan käyttää kemosensoreissa joilla tarkastellaan solunsisäisiä molekyylejä ja reaktioita[6] sekä tutkia biokemiallisten reaktioiden kinetiikkaa.[7]
Lähteet
[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]- ↑ a b c d Joseph R. Lakowicz: Principles of Fluorescence Spectroscopy, 3rd Edition, s. 13. Springer, 2006. ISBN 978-0387-31278-1 (englanniksi)
- ↑ Lakowicz, s. 444
- ↑ Lakowicz, s. 460
- ↑ Sapkota K, Kaur A, Megalathan A, Donkoh-Moore C, Dhakal S: Single-Step FRET-Based Detection of Femtomoles DNA. Sensors, August 2019, 19. vsk, nro 16, s. 3495. PubMed:31405068 PubMed Central:6719117 doi:10.3390/s19163495
- ↑ Lakowicz, ss. 462-465
- ↑ Wu L, Huang C, Emery BP, Sedgwick AC, Bull SD, He XP, Tian H, Yoon J, Sessler JL, James TD: Förster resonance energy transfer (FRET)-based small-molecule sensors and imaging agents. Chemical Society Reviews, August 2020, 49. vsk, nro 15, s. 5110–5139. PubMed:32697225 PubMed Central:7408345 doi:10.1039/C9CS00318E Artikkelin verkkoversio.
- ↑ Liu Y, Liao J: Quantitative FRET (Förster Resonance Energy Transfer) analysis for SENP1 protease kinetics determination. Journal of Visualized Experiments, February 2013, nro 72, s. e4430. PubMed:23463095 PubMed Central:3605757 doi:10.3791/4430