Mikrosatelliitti (biologia)

–ATCATCATCATCATC–

Trinukleotidimikrosatelliitin toistojakso (ATC) 5.

Mikrosatelliitti eli SSR- tai STR-markkeri (simple sequence repeat, short tandem repeat) on DNA-alue (lokus), joka koostuu muutaman emäsparin aiheen toistoista. Tyypillinen dinukleotiditoistoista koostuva mikrosatelliitti on esimerkiksi CACACACACACACA eli (CA)₇. Genomissa esiintyessään mikrosatelliittien pituus, so. toistojen lukumäärä, vaihtelee yksilöiden välillä ja niitä voidaan käyttää tehokkaina merkkiominaisuuksina populaatiogeneettisissä tutkimuksissa, rikostutkinnassa, isyystestauksessa ja geenikartoituksessa.

Mikrosatelliittien käyttökelpoisuutta vahvistaa se että ne ovat yhtäältä tyypillisesti luonnonvalinnan kannalta neutraaleja ja toisaalta periytymiseltään kodominantteja. Mikrosatelliittien runsaan vaihtelevuuden takia ne ovat erittäin tehokkaita yksilöiden erottelussa "geneettisinä sormenjälkinä" (genetic fingerprints): jo muutamalla merkkigeenillä voidaan luotettavasti tunnistaa yksilöitä ja varmistaa sukulaisuussuhteita. Mikrosatelliitteja on genomissa tuhansittain.

Mikrosatelliittimarkkerit jaotellaan toistojakson pituuden perusteella, mono- di- tri- ja tetranukleotidimarkkereihin, joissa toistojakson pituus on joko yksi, kaksi, kolme tai neljä emästä. Mikrosatelliittilokuksen eri alleelit puolestaan eroavat toisistaan perättäisten toistojaksojen kappalemäärän perusteella. Toistojen määrä vaihtelee yleensä kymmenen ja sadan välillä.

Katso myös

• Yhden emäksen monimuotoisuus (SNP)
• RFLP
• DNA-profilointi
• Geenisukututkimus

Lähteet

• Alberts, B., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K. & Walter, P.: Molecular Biology of the Cell, 4^th edition. Garland Science, 2002. ISBN 0-8153-4072-9 Teoksen verkkoversio. (englanniksi)
• Futuyma, Douglas J.: Evolutionary Biology. (Third Edition) Sunderland, Massachusetts: Sinauer Associates, 1998. ISBN 0-87893-189-9 (englanniksi)

Aiheesta muualla

• European Network of Forensic Science Institutes (ENFSI): STR Population Database (englanniksi)
• National [USA] Institute of Standards and Technology (NIST): STR database, STR Fact Sheets (englanniksi)